Articles

Structure of human salivary alpha-amylase at 1.6 A resolution: implications for its role in the oral cavity

Slinná alfa-amyláza, hlavní složka lidských slin, hraje roli při počátečním trávení škrobu a může se podílet na kolonizaci bakterií, které se podílejí na časné tvorbě zubního plaku. Byla stanovena trojrozměrná atomární struktura slinné amylázy, aby bylo možné pochopit vztahy mezi strukturou a funkcí tohoto enzymu. Tato struktura byla zpřesněna na hodnotu R 18,4 % s 496 aminokyselinovými zbytky, jedním vápenatým iontem, jedním chloridovým iontem a 170 molekulami vody. Salivární amylasa se skládá do multidoménové struktury sestávající ze tří domén, A, B a C. Doména A má (beta/alfa)(8-) soudkovitou strukturu, doména B nemá žádnou určitou topologii a doména C má soudkovitou strukturu s řeckým klíčem. Ca(2+) ion je vázán na Asnl00, Arg158, Asp167, His201 a tři molekuly vody. Iont Cl(-) je vázán na Arg195, Asn298 a Arg337 a jednu molekulu vody. Vysoce pohyblivá smyčka 304-310 bohatá na glycin může fungovat jako brána pro vazbu substrátu a podílet se na mechanismu „trap-release“ při hydrolýze substrátů. Strategické umístění vápenatých a chloridových iontů a histidinových a tryptofanových zbytků může hrát roli při rozlišování mezi glykonovým a aglykonovým koncem polysacharidových substrátů. Salivární amyláza má také vhodné místo pro vazbu na povrch skloviny a poskytuje potenciální místa pro vazbu bakteriálních adhezinů.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.