Articles

PacBio Sequel II Library Prep & Sequencing

Kérem, tekintse meg a: Bevezetés a PacBio szekvenálásba és Általános információk, vagy küldjön mintát a benyújtási űrlapunkkal.

PacBio Sequel II és Sequel IIe szekvenálás: Szolgáltatások és teljesítmény

Teljes PacBio könyvtárelőkészítési, BluePippin méretválasztási és szekvenálási szolgáltatásokat kínálunk. A szolgáltatás tartalmazza a bázishívást és a másodlagos elemzéseket, mint például a Reads-Of-Insert extrakció, HGAP assembly (kis genomok) és IsoSeq elemzések egyetlen vagy kis számú SMRT-sejtről. A PacBio szekvenáló és az SMRT-LINK elemzések által generált teljes adathalmazt letölthetővé tesszük a szervereinkről. A Bioinformatikai mag a PacBio szekvenciaadatok mélyreható elemzéseit kínálja. Mostantól HMW-DNS izolálást is kínálunk szolgáltatásként. Mivel “egymolekulás szekvenálási” technológiáról van szó, a PacBio szekvenálási adatok minősége és hozama nagyban függ a DNS- és RNS-minták minőségétől.

A PacBio Sequel II és Sequel IIe szekvenálók

A Sequel II és IIe a harmadik generációs PacBio szekvenálók. Most már akár 8x több szekvenálási adatot generálnak SMRT-cellánként, mint a Sequel I. A leolvasási hossz mérőszámok im). Kérjük, lassan futtassa az elektroforézist (pl. 80V-on a beállításoktól függően).

  • A minta tisztaságának értékelése spektrofotometriával – a 260/280 aránynak 1,8 és 2,0 között kell lennie, a 260/230 aránynak pedig 2,0-nál magasabbnak kell lennie. A PacBio a MoBio PowerClean oszlopokat ajánlja a mintatisztításhoz, vagy szükség esetén a fent említett magas sótartalmú/fenol/klórform protokollt.
  • A DNS mennyiségi meghatározásához lehetőség szerint fluorometriás módszereket (pl. Qubit) használjon. Minden mintát legalább 3-szor mérjen meg, és csak reprodukálható méréseket fogadjon el (a HMW DNS gyakran nem oldódik tökéletesen). A spektrofotometria nem megbízható a mennyiségi meghatározásokhoz (különösen, ha a DNS extrakciós protokoll CTAB-t használt).
  • A PacBio könyvtárak készítéséhez használt DNS-mintákat rendkívül óvatosan kell kezelni – ha a DNS-t a létesítményünkbe kell szállítani, kérjük, olvassa el a következő PacBio szállítási és kezelési irányelveket. További információ és a beküldési űrlap itt található. A beküldési űrlap elektronikus és nyomtatott példányát be kell kapnunk.

    Árak

    A PacBio szekvenálás költségei a szükséges könyvtárak és SMRT sejtek számát tükrözik. Feltöltési díjainkat itt tekintheti meg. A felsorolt díjak tartalmazzák az összes munkadíjat és reagenseket. A BluePippin méretválasztás opcionális (és további díjjal jár), de erősen ajánlott. Kérjük, vegye figyelembe a csökkentett nagy áteresztőképességű (HT) feltöltési díjainkat; ezek akkor érvényesek, ha mintánként 10 vagy több SMRT-sejtet szekvenálunk, vagy ha 6 vagy több könyvtárat hozunk létre.

    Vélemény, hozzászólás?

    Az e-mail-címet nem tesszük közzé.