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PacBio Sequel II Library Prep & Sequence

Please also see the: Introdução ao Sequenciamento PacBio e Informações Gerais ou envie uma amostra com nosso formulário de submissão.

PacBio Sequel II e Sequel IIe Sequel IIe Sequel: Serviços e Desempenho

PacBio oferece serviços completos de preparação da biblioteca PacBio, BluePippin size selection e sequenciação. A chamada de base e análises secundárias como extração Reads-Of-Insert, montagem HGAP (pequenos genomas) e análises IsoSeq de células SMRT simples ou um pequeno número de células SMRT estão incluídas no serviço. Fornecer-lhe-emos o conjunto de dados completo gerado pelo sequenciador PacBio e as análises SMRT-LINK para transferência dos nossos servidores. O Bioinformatics Core está a oferecer análises profundas dos dados da sequência PacBio. Agora oferecemos o isolamento HMW-DNA como um serviço. Devido a ser uma tecnologia de “sequenciamento monomolécula”, a qualidade e rendimento dos dados da sequência PacBio dependerá muito da qualidade das amostras de DNA e RNA.

Os sequenciadores PacBio Sequel II e Sequel IIe

Os sequenciadores PacBio Sequel II e IIe representam a terceira geração de sequenciadores PacBio. Eles agora geram até 8x mais dados de sequenciamento por célula SMRT em comparação com a Sequel I. As métricas de comprimento de leitura têm im). Execute a electroforese lentamente (por exemplo, a 80V, dependendo da configuração).

  • Avalie a espectrofotometria de pureza da amostra – a relação 260/280 deve estar entre 1,8 e 2,0 e a relação 260/230 deve ser superior a 2,0. PacBio recomenda colunas MoBio PowerClean para limpeza de amostras ou o protocolo de alto sal/fenol/clorofórmio mencionado acima se necessário.
  • Por favor, use métodos fluorométricos (por exemplo, Qubit) para quantificação de DNA, se possível. Meça cada amostra pelo menos 3 vezes e aceite apenas medições reprodutíveis (o DNA HMW muitas vezes não é perfeitamente dissolvido). A espectrofotometria não é confiável para quantificações (especialmente se o protocolo de extração de DNA usou CTAB).
  • As amostras de DNA usadas para fazer bibliotecas PacBio devem ser manuseadas com extremo cuidado – se você precisar enviar seu DNA para nossas instalações, por favor, consulte as seguintes diretrizes para envio e manuseio do PacBio. Mais informações e o formulário de envio podem ser encontrados aqui. Temos de receber cópias electrónicas e impressas do formulário de envio.

    Preços

    Custos da sequenciação PacBio reflectem o número de bibliotecas e o número de células SMRT necessárias. As nossas taxas de recarga podem ser visualizadas aqui. As taxas listadas incluem toda a mão-de-obra e reagentes. A selecção do tamanho do BluePippin é opcional (e implica uma taxa adicional), mas é altamente recomendada. Tenha em atenção as nossas taxas de recarga elevadas (HT) reduzidas; estas aplicam-se se forem sequenciadas 10 ou mais células SMRT por amostra ou se forem geradas 6 ou mais bibliotecas.

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