Articles

PacBio Sequel II Library Prep & Sequencing

Vă rugăm să consultați și: Introducere în secvențierea PacBio și Informații generale sau trimiteți o mostră cu ajutorul formularului nostru de trimitere.

PacBio Sequel II și Sequel IIe Sequencing: Services and Performance

Oferim servicii complete de pregătire a bibliotecilor PacBio, de selecție a dimensiunilor BluePippin și de secvențiere. Chemarea bazelor și analizele secundare, cum ar fi extracția Reads-Of-Insert, asamblarea HGAP (genomuri mici) și analizele IsoSeq ale celulelor SMRT unice sau ale unui număr mic de celule SMRT sunt incluse în serviciu. Vă vom furniza setul complet de date generat de secvențiatorul PacBio și de analizele SMRT-LINK pentru descărcare de pe serverele noastre. Bioinformatics Core oferă analize aprofundate ale datelor de secvențiere PacBio. Oferim acum izolarea HMW-DNA ca serviciu. Datorită faptului că este o tehnologie de „secvențiere cu o singură moleculă”, calitatea și randamentul datelor de secvență PacBio vor depinde în mare măsură de calitatea probelor de ADN și ARN.

Secvențiatoarele PacBio Sequel II și Sequel IIe

Secvențiatoarele Sequel II și IIe reprezintă a treia generație de secvențiatoare PacBio. Acestea generează acum de până la 8 ori mai multe date de secvențiere pe celulă SMRT în comparație cu Sequel I. Măsurătorile lungimilor de citire au im). Vă rugăm să efectuați electroforeza încet (de exemplu, la 80V, în funcție de configurație).

  • Avaluați puritatea probei prin spectrofotometrie – raportul 260/280 ar trebui să fie între 1,8 și 2,0, iar raportul 260/230 ar trebui să fie mai mare de 2,0. PacBio recomandă coloanele MoBio PowerClean pentru curățarea probei sau protocolul cu conținut ridicat de sare/fenol/cloroform menționat mai sus, dacă este necesar.
  • Vă rugăm să utilizați metode fluorometrice (de exemplu, Qubit) pentru cuantificarea ADN-ului, dacă este posibil. Măsurați fiecare probă de cel puțin 3 ori și acceptați numai măsurători reproductibile (ADN HMW nu este adesea perfect dizolvat). Spectrofotometria nu este fiabilă pentru cuantificări (mai ales dacă protocolul de extracție a ADN-ului a utilizat CTAB).
  • Eșantioanele de ADN utilizate pentru realizarea bibliotecilor PacBio trebuie manipulate cu extremă grijă – dacă trebuie să expediați ADN-ul dvs. la instalația noastră, vă rugăm să consultați următoarele orientări PacBio pentru expediere și manipulare. Mai multe informații și formularul de trimitere pot fi găsite aici. Trebuie să primim copii electronice și tipărite ale formularului de trimitere.

    Prețuri

    Costurile pentru secvențierea PacBio reflectă numărul de biblioteci și numărul de celule SMRT necesare. Tarifele noastre de reîncărcare pot fi vizualizate aici. Tarifele enumerate includ toată forța de muncă și reactivii. Selectarea dimensiunii BluePippin este opțională (și presupune o taxă suplimentară), dar este foarte recomandată. Vă rugăm să rețineți tarifele noastre reduse de reîncărcare de mare randament (HT); acestea se aplică dacă sunt secvențiate 10 sau mai multe celule SMRT per eșantion sau dacă sunt generate 6 sau mai multe biblioteci.

    .

    Lasă un răspuns

    Adresa ta de email nu va fi publicată.